MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Paris plasmid pLPP

Total Repeats: 314

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006365	CA	3	6	34	39	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006365	TC	3	6	947	952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006365	CAT	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006365	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006365	A	7	7	1172	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006365	AATTTT	2	12	1211	1222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006365	A	6	6	1257	1262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006365	ATTA	2	8	1270	1277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006365	TAA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006365	TAG	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006365	TAT	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006365	TGG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006365	GTTC	2	8	4912	4919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006365	AGTA	2	8	4968	4975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006365	T	8	8	5569	5576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006365	A	6	6	8083	8088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006365	TA	3	6	8301	8306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006365	ATT	3	9	8361	8369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006365	TTA	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006365	TTGA	2	8	8403	8410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006365	TCT	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006365	TTA	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006365	GCT	2	6	10896	10901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006365	GTT	2	6	10930	10935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006365	TA	3	6	10977	10982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006365	A	6	6	14392	14397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006365	T	6	6	14407	14412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006365	AAT	2	6	14449	14454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006365	AAT	2	6	14460	14465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006365	AAT	2	6	14481	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006365	AGA	2	6	14697	14702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006365	CAA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006365	A	6	6	15821	15826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006365	ATGG	2	8	16184	16191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006365	TAAA	2	8	16222	16229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006365	A	6	6	16227	16232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006365	A	6	6	16237	16242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006365	A	6	6	16279	16284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006365	TTA	2	6	16292	16297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006365	CTA	2	6	16670	16675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006365	TTC	2	6	16681	16686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006365	GGA	2	6	16702	16707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006365	T	7	7	18550	18556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006365	G	6	6	18561	18566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006365	TCA	2	6	18618	18623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006365	A	6	6	18643	18648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006365	TCA	2	6	18690	18695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006365	T	6	6	22297	22302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006365	ATG	2	6	26845	26850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006365	AAG	2	6	34790	34795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006365	TAT	2	6	36841	36846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006365	TTA	2	6	42801	42806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006365	A	7	7	42843	42849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006365	ATT	2	6	42864	42869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006365	AATTA	2	10	42871	42880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006365	CTAT	2	8	43197	43204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006365	AT	3	6	43223	43228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006365	TAT	2	6	44110	44115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006365	TTATT	2	10	44223	44232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006365	TA	4	8	44236	44243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006365	GTG	2	6	44287	44292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006365	TG	4	8	44291	44298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006365	TAC	2	6	44338	44343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006365	AAT	2	6	44359	44364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006365	AATA	2	8	44374	44381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006365	TTGCA	2	10	45144	45153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_006365	A	6	6	45177	45182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006365	TAA	2	6	45190	45195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006365	AAG	2	6	45204	45209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006365	ATTT	2	8	45212	45219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006365	TTA	2	6	45220	45225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006365	T	6	6	45259	45264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006365	TAATAG	2	12	45278	45289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006365	GTG	2	6	45629	45634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006365	ATG	2	6	45661	45666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006365	ATT	2	6	46098	46103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006365	ATT	2	6	46111	46116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006365	TTGT	2	8	46216	46223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006365	T	8	8	46259	46266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006365	ATA	2	6	46267	46272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006365	TAT	2	6	46751	46756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006365	CAA	2	6	46803	46808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006365	A	6	6	46807	46812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006365	T	6	6	46831	46836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006365	ACC	2	6	47483	47488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006365	ATT	2	6	47551	47556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006365	GTTAC	2	10	47585	47594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_006365	CAAT	2	8	47621	47628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006365	TATAA	2	10	47656	47665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006365	TTAT	2	8	47711	47718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006365	TTG	2	6	49279	49284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006365	GAA	2	6	49295	49300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006365	A	7	7	52381	52387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006365	GATTG	2	10	52425	52434	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006365	T	6	6	52490	52495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006365	TA	3	6	56385	56390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006365	CTCC	2	8	57420	57427	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_006365	A	6	6	57447	57452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006365	TTA	2	6	57719	57724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006365	TAT	2	6	58112	58117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006365	ATCT	2	8	58184	58191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006365	TTA	2	6	58192	58197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006365	TTG	2	6	58208	58213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006365	TAAA	2	8	58230	58237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006365	AGT	3	9	58241	58249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006365	TAC	2	6	58994	58999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006365	CAA	2	6	59010	59015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006365	CAA	2	6	59068	59073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006365	TCA	2	6	59075	59080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006365	TTATT	2	10	59082	59091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006365	AGA	2	6	59954	59959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006365	AT	3	6	61407	61412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006365	TTA	2	6	61442	61447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006365	C	6	6	61802	61807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_006365	ATT	2	6	61838	61843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006365	ATA	2	6	61861	61866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006365	A	6	6	61869	61874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006365	AG	4	8	61937	61944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006365	T	7	7	61966	61972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006365	A	6	6	69265	69270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006365	TA	3	6	69291	69296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006365	TTAA	2	8	70318	70325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006365	CCA	2	6	70369	70374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_006365	A	6	6	70396	70401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006365	A	9	9	70407	70415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006365	GTT	2	6	73610	73615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006365	TA	4	8	73669	73676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006365	AGT	2	6	73691	73696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006365	TCA	2	6	73720	73725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006365	TA	3	6	73775	73780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006365	CAC	2	6	73823	73828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006365	CTA	2	6	73858	73863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006365	TAG	2	6	73870	73875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006365	CTA	2	6	73879	73884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006365	TAG	2	6	73891	73896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006365	TTTA	2	8	73904	73911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006365	TA	3	6	76315	76320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006365	ATG	2	6	76328	76333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006365	GTT	2	6	76338	76343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006365	TGA	2	6	79638	79643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006365	TAT	2	6	79705	79710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006365	A	6	6	79717	79722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006365	TAT	2	6	79754	79759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006365	CAT	2	6	81887	81892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_006365	CAT	2	6	81918	81923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006365	ATAA	2	8	84667	84674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006365	TAG	2	6	84738	84743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006365	CGA	2	6	84744	84749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_006365	CAG	2	6	85676	85681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_006365	CTC	2	6	86460	86465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_006365	ACA	2	6	86472	86477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_006365	ATA	2	6	86517	86522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006365	T	7	7	86524	86530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_006365	A	7	7	88220	88226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_006365	ATT	2	6	130085	130090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_006365	AT	3	6	130093	130098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_006365	AAC	2	6	130178	130183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_006365	T	7	7	130210	130216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_006365	CAAA	2	8	130286	130293	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_006365	TAA	2	6	130301	130306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006365	TCTCTT	2	12	130316	130327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_006365	T	6	6	130350	130355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_006365	TCT	2	6	130369	130374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_006365	GAT	3	9	130633	130641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_006365	TCAGGC	2	12	130684	130695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_006365	ATG	2	6	130838	130843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_006365	TCC	2	6	130851	130856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_006365	CCGCC	2	10	130994	131003	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
293	NC_006365	CT	3	6	131004	131009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_006365	CCCA	2	8	131014	131021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
295	NC_006365	AATC	2	8	131045	131052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
296	NC_006365	TA	3	6	131084	131089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_006365	GTT	2	6	131174	131179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_006365	TGC	2	6	131196	131201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_006365	TCC	2	6	131215	131220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_006365	A	6	6	131305	131310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_006365	ATCTAA	2	12	131328	131339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
302	NC_006365	CTC	2	6	131349	131354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
303	NC_006365	AGC	2	6	131362	131367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_006365	TTC	2	6	131398	131403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_006365	TAA	2	6	131493	131498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_006365	TTC	2	6	131527	131532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_006365	TTC	2	6	131587	131592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_006365	CCT	2	6	131698	131703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
309	NC_006365	TTC	2	6	131719	131724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_006365	A	7	7	131740	131746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_006365	TCT	2	6	131795	131800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_006365	TTG	2	6	131809	131814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NC_006365	TCA	2	6	131844	131849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_006365	CTT	2	6	131873	131878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.